Gesellschafter der Ecclesia Holding GmbH sind die Evangelische Kirche in Deutschland, der Deutsche Caritasverband e. V. und das Evangelische Werk für Diakonie und Entwicklung e.V.
Beim zur Gruppe gehörenden Unternehmen UNION Versicherungsdienst GmbH ist der Deutsche Paritätische Wohlfahrtsverband – Gesamtverband e. V. seit 1960 Mitgesellschafter.